Vous souhaitez contribuer à l'efficacité de nos outils et développements Bio-informatiques ? Rejoignez-nous !

Au sein de notre Division Grandes Cultures / Traits et Technologies, nous cherchons un Bio-informaticien(ne), pour un CDI basé sur notre site de Chappes (63), à 20 kms de Clermont-Ferrand.

Au sein de l'équipe Biostatistiques & Bioinformatique, vous contribuerez à fournir des méthodes et des outils pour organiser, structurer et exploiter les données génomiques afin de soutenir les applications de sélection et les efforts de découverte de gènes, et contribuer ainsi au développement de nouvelles technologies de génération de données en laboratoire. 

------

OVERALL MISSION :
You would like to contribute to the efficiency of our bioinformatics tools and development? Join us!

Within the global research organization of the Field Seeds Division / Trait and Technologies, we are opening a permanent contract for a senior bioinformatician on our Chappes site, located at 20 kms from Clermont-Ferrand.

Within the biostatistics / bioinformatic platform teams, you will help to provide methods and tools to organize, structure and leverage genomic data to support breeding applications and gene discovery efforts, will contribute to the development of new data generation technologies in the lab.

Vos principales activités consisteront à contribuer à l'organisation et à la mise en œuvre de notre portefeuille d'outils et de pipelines bio-informatiques. Vous vous efforcerez d'améliorer en continu l’efficacité de nos processus.

Vous superviserez l'intégration de ces nouveaux outils et pipelines qui facilitent la découverte scientifique grâce à la génomique.

Vous agirez en tant qu'expert du domaine Bio-informatique pour des projets clés, fournissant des connaissances et un soutien à nos généticiens participant à la sélection ou à la découverte de gènes.

Vous apporterez des solutions et des innovations pour renforcer l'efficacité de l'analyse des données génomiques/pangénomiques.

Vous contribuerez à la formation et au soutien des différentes équipes de recherche sur l'utilisation des outils/pipelines Bio-informatiques.

Vous ferez partie de notre communauté de chercheurs et contribuerez à l'émulation scientifique au sein de Limagrain et plus particulièrement au sein de notre branche Grandes Cultures.

Le poste est rattaché au Chef d'équipe Bioinformatique au sein de notre Centre de Recherche de Chappes (63), qui regroupe différentes équipes de sélection et de support à la sélection.

------

MAIN ACTIVITIES :

You will contribute to the organization and execution of our Bioinformatics Tools and Pipelines portfolio and strive for the constant improvement and efficiency of our processes.

You will oversee the integration of new bioinformatic tools and pipelines that facilitate scientific discovery through genomics.

You will act as domain expert in bioinformatics for key projects, providing knowledge and support to our scientists in crop genetics and gene discovery.

You will bring forward solutions and innovations to strengthen the efficiency in analysis of genomic/pangenomic data.

You will contribute to the training and support of the different research teams on the use of bioinformatics tools/pipelines.

You will be part of the research community and contribute to the scientific emulation within Limagrain and especially within Limagrain Field Seeds Research.
The position reports to the Bioinformatics Team Leader within our Chappes research center which centralizes different scientific skills and breeding teams.

Vous avez un Doctorat en Bio-informatique, Biostatistiques et/ou Génomique. 

Vos connaissances en Bioinformatiques appliquées à l'analyse des données «omiques» sont maîtrisées et démontrées. Créatif et innovant, vous avez l'habitude de mettre en place des solutions et des outils en adéquation avec les besoins de la recherche. Vous maîtrisez la programmation et savez développer des workflows pour gérer, analyser, visualiser et générer des rapports sur de grands ensembles de données..

Vous travaillez dans un environnement Linux ou Unix, êtes à l'aise avec l'utilisation du HPC et autres solutions d'ordonnancement (ex: Slurm, LSF ou équivalent).Vous maîtrisez Python, Perl ou tout autre  langage similaire orienté analyse de données. Une expérience avec GIT et NetFlow serait un plus.

Vous avez déjà géré des projets de recherche de la conception à la conclusion incluant l'organisation et la planification des opérations, l'analyse et l'interprétation des résultats. 

Vous avez un esprit d'équipe et possédez d'excellentes compétences en communication et en relations interpersonnelles tant à l'oral qu'à l'écrit. Vous avez un réseau actif de contacts académiques et industriels. Vous maîtrisez l'anglais tant à l'oral qu'à l'écrit. Une connaissance pratique de la génétique, en particulier pour les plantes, serait un plus. 

Ce poste est à pourvoir en CDI dès le 2 janvier 2023 dans notre Centre de Recherches de Chappes (63), à 20 kms de Clermont-Ferrand.

Merci de postuler sur notre site talent.limagrain.com avec la référence 2022-7912.

------

PROFILE :

You have a PhD in Bioinformatics/Computational Biology/Genomics, anda strong and demonstrated knowledge in bioinformatics applied analysis of “omics” data.

Creative and innovative, you have a record of implementing solutions and tools in line with research needs. You are proficient in programming with emphasis on developing workflows to handle, analyze, visualize and generate reports on large datasets.

You master working in a Linux or Unix environment and are comfortable utilizing HPC and queues (e.g. Slurm, LSF or equivalent).
You have a strong proficiency in programming in Python, Perl or a similar data analysis-oriented language. Experience with GIT and NetFlow would be a plus.
You have managed research projects from conception to conclusion including organization and planification of the operations, analysis and interpretation of results

You have a team-working spirit and possess excellent communication and inter-personal skills both verbal and written. You have an active network of academic and industry contacts.
A working knowledge of genetics, especially for plants, would be advantageous.
You master English both oral and written. French speaking would be a plus.

This permanent position is to be filled at our Center of Research in our Chappes site, located at 20 kms from Clermont-Ferrand.

Please apply on our website talent.limagrain.com with the reference 2022-7912.